Jason Bourne viene strappato alla morte dal tempestivo intervento di un peschereccio italiano nel Mediterraneo. L'uomo che soffre di amnesia cerca di riapproppriarsi del suo passato che gli ha lasciato i segni di due pallottole conficcate nella schiena, una propensione per le botte e le lingue straniere, qualche killer alle calcagna. Nella sua ricerca è affiancato da una misteriosa giovane donna.