La storia vede il protagonista rimanere orfano della madre (morta per salvare il marito ed il figlio), sullo sfondo della crudele guerra tra lo Shogun Ieyasu Tokugawa e i suoi oppositori capitanati dal principe Hideyori Toyotomi e dal suo più valente generale, Yukimura Sanada, di cui il clan dei Sarutobi (a cui appartiene la famiglia di Sasuke) è fedele seguace. Con la sconfitta nello scontro finale della fazione di Toyotomi (e il suo conseguente suicidio), e la morte in battaglia di Sanada, Tokugawa ordina ai suoi uomini di sterminare tutti i sopravvissuti della parte avversaria, tra i quali anche il formidabile ninja Daisuke Oozaru, il padre del piccolo Sasuke. Dopo alcune peripezie Sasuke e Oozaru si ricongiungono ed iniziano la difficile fuga dai sicari dello Shogun.
