Le due sacerdotesse di Mothra avvertono il governo giapponese che è stato un errore utilizzare le ossa del primo Godzilla per creare Mechagodzilla: è stato questo a provocarne il ritorno. Bisogna restituire le ossa al mare; in caso contrario l’umanità dovrà vedersela anche con Mothra. Le autorità giapponesi sono scettiche, mentre il ritorno di Godzilla è imminente…
