Prima di fare squadra con Scooby-Doo e il resto della loro banda di amici, la brillante Daphne e l'intelligente Velma sono due adolescenti che si dilettano a risolvere misteri. Si sono conosciute online e sono diventate buone amiche. Daphne, poi, si è appena trasferita nella stessa scuola di Velma, il tecnologico istituto Ridge Valley High, quando insieme si ritrovano a indagare sul mistero intorno alla scomparsa di alcuni degli studenti più brillanti.
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